Protein–RNA interactions for Protein: P41279

MAP3K8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K8P41279 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP3K8P41279 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms