Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms