Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms