Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms