Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms