Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB9P28065 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB9P28065 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms