Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms