Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APCP25054 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APCP25054 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APCP25054 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms