Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MSR1P21757 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSR1P21757 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSR1P21757 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSR1P21757 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
MSR1P21757 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSR1P21757 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
MSR1P21757 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSR1P21757 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MSR1P21757 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSR1P21757 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSR1P21757 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSR1P21757 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSR1P21757 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSR1P21757 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSR1P21757 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSR1P21757 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSR1P21757 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MSR1P21757 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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