Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRHP20396 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRHP20396 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRHP20396 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRHP20396 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRHP20396 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRHP20396 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRHP20396 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRHP20396 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRHP20396 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRHP20396 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms