Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms