Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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HOXD4P09016 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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HOXD4P09016 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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HOXD4P09016 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXD4P09016 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXD4P09016 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXD4P09016 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXD4P09016 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXD4P09016 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXD4P09016 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD4P09016 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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