Protein–RNA interactions for Protein: P07202

TPO, Thyroid peroxidase, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPOP07202 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPOP07202 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPOP07202 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms