Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VIPP01282 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VIPP01282 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VIPP01282 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VIPP01282 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VIPP01282 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VIPP01282 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VIPP01282 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VIPP01282 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
VIPP01282 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VIPP01282 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VIPP01282 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VIPP01282 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VIPP01282 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VIPP01282 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VIPP01282 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms