Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf47O95873 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms