Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX4O95219 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms