Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNUPNO95149 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms