Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms