Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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