Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCL13O43927 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms