Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TO15178 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TO15178 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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