Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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