Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F3O00716 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F3O00716 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms