Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SDR42E2A6NKP2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms