Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms