Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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