Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms