Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms