Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP3K4Q9Y6R4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP3K4Q9Y6R4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms