Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PARP3Q9Y6F1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms