Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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