Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms