Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF8Q9UPP1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms