Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms