Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms