Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms