Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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COPS7AQ9UBW8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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COPS7AQ9UBW8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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