Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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