Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIT1Q9P2V4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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