Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D2AQ9P2K1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms