Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms