Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms