Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms