Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE41Q9C0J9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms