Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms