Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms