Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA5Q9BWX5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms