Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms