Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF6Q99612 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms