Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3R4Q99570 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms